非常普通的高中生多华宫仄在大扫除时发现了被扔到垃圾桶里的布制玩偶，而就如那只布制玩偶上“晴天 有时 校舍从天而降”的文字一样，校舍的钟楼在头上向下倾倒，就在这个时候仄得到了他的同班同学——炎之魔女火火里绫火的帮助。以与她的邂逅为契机，多华宫仄和火火里的爆炎学园生活故事。 高中生多华宫仄在某次值日中发现了一个写着奇怪文字的布制玩偶，如同玩偶上的预言一样旧校舍的钟从天而降，就在这时，人气爆棚的邻座火火里绫火变身炎之魔女及时将他解救。自此以后，身份暴露的火火里便放弃了暗中保护的方式，开始积极介入宫仄的生活，没想到多仄再次遭到塔之魔女仓石蒲公英的袭击，所幸火火里将她驱逐，但没过多久仓石蒲公英就和自己的魔女同伴一同转入了宫仄的班级。
CIA（美国中央情报局）探员汤姆•毕晓普（布拉德•彼特饰）在远东某国执行任务失败，随即被当局逮捕，并将于24小时内被执以死刑。此时远在美国，汤姆的搭档，CIA探员内森 D.缪尔（劳勃·瑞福饰）正在为营救汤姆而游说CIA高层。
《战国BASARA》中活跃的武将们，在现代高中再次展开了激烈的战斗：前任学生会长“丰臣秀吉”遭到停学处分，学园内群雄割据，为争夺新会长之位成为乱世。
