故事内容延续第一部TV版攻壳机动队STAND ALONE COMPLEX的剧情继续发展。但TV版的2部作品与剧场版无甚联系，可以看做是两个平行世界里发生的事情。 这次TV版第2季的制作班底与第一部相同，同时剧情表达上和第一季一样，每话由不同故事构成，各自独立成章，却贯穿着同一条主线。在剧情上同时电影版导演押井守也参与了协力，不过电影版中凄凉的气氛没有在TV版第二季中体现。
几个月内，有一系列失踪妇女在夜间返回，其中包括妓女、学生和其他人。没有人知道他们被杀害，他们的尸体被肢解，他们的生殖器被切掉，甚至被拍下来欣赏。也许当他们登上出租车时，还没有发现那个英俊的司机李德仁就是那个女屠夫。
