为了保护数码世界和数码兽，四圣兽之一朱雀兽接连不断的将帝魔送往人类世界，造成了危险和混乱，启人和好友牧野留姬（折笠富美子 配音）、李健良（山口真弓 配音）一起为了保护和平加入了战斗之中。不仅如此，朱雀兽还带走了掌握着数码兽进化关键的古乐兽，追随着古乐兽的踪迹，启人一行人闯入了数码世界，展开了大冒险。
故事发生在一个叫“蒲岛”的偏远小岛上。尽管风景如画，那里的人简单自由，但世代居住在那里的土著人受到过去事件和古老繁文缛节的限制。随着时间的推移，看不到未来希望的居民开始自暴自弃。
堀被宫村在学校与校外截然不同的形象震惊到了。而以关心不擅长与人交往的创太为契机，宫村开始频繁的访问堀家，同时也挖掘出堀“家庭的抖S”的一面……
