让我们与来自利科、罗伊和帕提亚地区的三种神奇宝贝原始生物一起，在神奇宝贝的世界里展开一场激动人心的冒险！
同一天，身着黑衣的美女黑泽菊里受哥哥委托，将一个银色手提箱交给夏目直树，并唤醒一种名为“聪明的魔神”的神秘武器。借着获得这个手提箱的机会，志纯了解到了这个世界隐藏的真相——上帝已经抛弃了人类，这个世界一度被摧毁，利用“恶魔”的力量重新生成了“第二世界”。被命令使用武器拯救世界的志纯遇到了一个自称是恶魔的女巫，以及一个同样被鬼魂困扰的学生校长。男主人公被无数不同类型的漂亮女孩包围，华丽的故事应该开始了
学校里的音乐大赛结束了。可是日野香穗子仍然一如既往地进行着小提琴的练习。她再次对自己与其它参赛选手之间的实力差距有了认识，但仍然抱着喜欢小提琴的心情全心投入地继续努力着。
