谁知当一切都按部就班进行之时，意外突然发生。与此同时，距离大使馆不远的一座摩天大楼内，日本首相遭到密码箱炸弹的暗杀，素子之前的上司陆军501机关的机关长库露兹（浅野麻由美 饰）也在爆炸中丧生。经过缜密追查，素子等人发现一种能够篡改记忆的病毒正在网络蔓延，而她的身世居然和一连串的事件有着密切联系。危机当前，阴谋悄然复出水面…… 本片根据士郎正宗的同名原作改编，系《攻壳机动队》诞生25周年纪念作品。
一晚，一位勇士偷偷溜进了公主的闺房，向公主示爱 ，可被公主回绝了。打发走了拜访者，一个小魔女从暗道里走了出来，告诉公主魔法失效的根源，自己也丧失了法力，再也无法变回原样。第二天清晨，一个拥有法力的魔法师（小山刚志 配音）乘坐着飞艇造访城堡，迎娶公主。魔法师用自己的魔法威逼国王交出公主。其实，昨晚公主在与小魔女的交谈中已经醒悟了，意识到不能再消极地等待下去了，应该主动追求自己想要的生活。收拾了行囊，趁夜色溜出了城堡……
