在经历了几次波折后，军事特工索尔贝（斋藤智郎配音）利用地球的龙珠将弗利萨带回了地球，而新复活的恶魔国王迅速启动了他的复仇计划。半年后，强大的弗利萨军队降临地球，悟饭（野泽雅子配音）、大魔王比克（久川实夫配音）、克林、天津饭和武田老师站了起来。孙悟空（野泽雅子配音）和贝吉塔（Horikawa Ryuki配音）跟随维斯（森田成一配音）在遥远的宇宙深处接受审判。在危机时刻，入侵地球的消息终于传到了韦斯和比鲁斯的耳朵里，悟空和贝吉塔即将与他们命中注定的敌人进行另一场对抗
2008年に放送されたSFアニメ「マクロスF」の劇場版2部作の後編。2009年にロングランヒットを記録した前編「劇場版マクロスF イツワリノウタヒメ」に続き、新天地を目指して宇宙を旅する移民船団「マクロス・フロンティア」を舞台に、ナゾの生命体バジュラとの戦いに身を投じる少年アルトと歌姫シェリル、シェリルにあこがれる少女ランカが織りなすドラマを描く。前編と同じ、テレビ版の総監督を手がけた河森正治が監督を務める。
