偶然相遇、彼此完全不同的朱立和有奈，以及朱立毫无关联的弟弟梨阳和有奈青梅竹马的青梅竹梅兼部长，都是住在同一公寓、就读同一所学校的高中新生。有乃渴望李阳，李阳对朱立怀有一颗难以言喻的心。朱立隐藏了一个秘密，而何晨见证了某个秘密。
这部电影描述了电视剧版本中发生的故事，两人在接受工作委托后，作为合作伙伴再次会面，开始最初的案件。福尔摩斯研究人员和影迷称之为“福尔摩斯”系列历史上最高的杰作的长篇巨作《巴斯克维尔的猎犬》的故事是原案。
此后不久，特种部队冲进会场，救援行动顺利完成，导致巴中健在混乱中死亡。由于八重健的真正目的尚不清楚，而且在其被杀的过程中也存在谜团，杉田有京（水谷裕中饰）和神户（菊川光博饰）立即展开调查，发现这一切似乎与七年前的一次可能引发国际争端的恐怖袭击有关。另一方面，出于某种原因，高级警官不断施加压力，阻止专案组的调查。层层迷雾背后隐藏着什么惊人的真相？这部电影是同名电视剧的第二部剧场版。
