大学教授薛奎（郑雨生饰演）因性丑闻失去了一切，被贬到一个非常偏远的小镇工作。在那里，雪葵遇到了美丽的女孩德一（李旭饰演），两人坠入爱河。然而，不久之后，薛奎回到了原来的位置，即将回到大都市首尔。为了追求自己的未来，薛奎残忍地抛弃了德一。
季節は秋になり、結城理をはじめとしたペルソナ使いたちによる特別課外活動部と異形の怪物「シャドウ」との戦いにも、終わりが近づいていた。しかし、「影時間」を終わらせるためシャドウとの死闘を繰り広げる理の前に、謎の転校生・望月綾時が現れる。第3章監督は「銀河機攻隊マジェスティックプリンス」「デート・ア・ライブ」などを手がけてきた元永慶太郎。
