2008年に放送されたSFアニメ「マクロスF」の劇場版2部作の後編。2009年にロングランヒットを記録した前編「劇場版マクロスF イツワリノウタヒメ」に続き、新天地を目指して宇宙を旅する移民船団「マクロス・フロンティア」を舞台に、ナゾの生命体バジュラとの戦いに身を投じる少年アルトと歌姫シェリル、シェリルにあこがれる少女ランカが織りなすドラマを描く。前編と同じ、テレビ版の総監督を手がけた河森正治が監督を務める。
Poppin党的成员,如向成,他们在高中升到了二年级,无论是在学生会还是在家帮忙,辅导还是工作,都很忙。五人在一起的时间逐渐减少,也很难聚集在仓库里作为据点。在他们身边,一个年轻女孩出现了。一场全新的邂逅。一成不变的枷锁。