所谓的“虫”,是一种超越了科学解释范畴而存在的邪恶生物。它们专门附身在心怀梦想的少男少女身上,令他们拥有能够使用超能力的特异功能,政府称他们为“附虫者”。灾难性袭击对世界造成“第二次冲击”后,世界在废墟上重建。14岁的Ikashi Shinji被他的父亲Ikashi Moto召集到第三新东京城。我以为我能看到他受到父亲的欢迎,但我看到一个名叫“使徒”的巨大生物与军队交火。