二十年后的一天，初音岛风间书院官方新闻部门的权威遭到了非官方部门的大胆挑战。毕业季即将到来，出版《毕业季》特刊成为该系的首要任务。这一次，森原莉夏部长（新田惠海配音）决定调查传说中的樱花树，并将“魔法”作为杂志的主题。
11岁时，一个名叫Ashikaga Taichi（藤田淑子配音）的小男孩与他的朋友石田大和（Kazuma Yuko配音）、武内空子（Mizuya Yuko配音。然而，他出乎意料地神秘地被带到了一个五彩缤纷的数字世界。在那里，他们找到了一个叫“数码宝贝”的伙伴。进入数字世界后，八神太乙和他的同伴们遇到了凶猛的怪物贝壳兽。就在所有人都快要被抓住的时候，太一的古老野兽突然进化成了霸王龙并救了他们。进化究竟是如何对事件做出反应的？什么是数字世界？无数的谜团出现在被选中的孩子面前，激动人心的冒险就这样开始了
