游戏以前作 2 年后的日本乡村小镇“稻羽市”为舞台，玩家将扮演刚转学到稻羽市八十神高中 2 年级的主角，在追查神秘连续杀人事件时，潜在的“PERSONA”能力觉醒，同时也开启了进入异世界的大门，与其他 PERSONA 召唤者一同挑战神秘的迷宫。 游戏承袭前作的基本系统并加以强化，结合校园冒险与迷宫战斗 2 大部分。冒险部分将让玩家体验与形形色色的夥伴结交与互动的过程；战斗部分则让玩家与夥伴组队深入本作全新登场的乱数产生迷宫，发挥各自的 PERSONA 之力对抗异世界的神秘怪物。
强大的朋友账号吸引了各种怪物前来访问，给夏目带来了很多麻烦，但也让夏目继续成长。夏目追寻着怪物的记忆，并不断地了解她的祖母玲子。由于玲子独特的天赋，她在人群中总是孤独而孤独。深深理解玲子的夏目决心找到一个能够理解自己内心世界的人，并在这个过程中看到自己和祖母之间的差异。尽管生活似乎总是充满孤独感，但找到你想保护的人是非常幸福的。在这样一个从冬天到春天的季节里，夏目和他的猫老师给我们带来了阵阵温暖。
Kobe受警察厅副厅长Toyoki Kazumi（伊萨卡·宏饰演）指派，命令杉田和他的搭档Kazumy（奈良美子饰演）以调查谋杀案的名义前往凤凰岛，秘密调查生化武器的证据。特命二人组在民兵组织领导人真嗣（石原刚治饰演）的指导下抵达事故现场，而杉田则注意到事故背后似乎有一些人为因素。当他和随后到来的伊丹（川原和黑石饰演）逐渐接近真相时，这位诡计多端的政治家突然命令自卫队对他们采取行动
