柔泽十（细谷佳正 配音）是一个外表凶恶的金发不良少年，但在内心里，十对自己的个性和所作所为十分厌恶。某一天，十突然被一个自称与他有着前世羁绊的叫做堕花雨（広桥凉 配音）的诡异少女缠上了。
真道幸路朗是在外务省工作的干练交涉官。在羽田机场，真道所乘坐的客机正准备起飞时，空中出现了神秘的巨大立方体。“那个东西”急速地巨大化，并吞噬了载有252人的客机。巨大立方体的名字是“卡多”。
《创圣大天使LOGOS》讲述由于SNS的普及，现代的无意义文字正在增加。在文字的世界LOGOS WORLD，发生了影响到现实世界的异常事态。灰吹阳等创声部的成员为了解开文字中隐含的意义，直面世界的危机。
