故事发生在御伽学园里,大神凉子(伊藤静 配音)是一个身材娇小但个性十分凶悍的傲娇少女。在学园中,有一个名为御伽学园学生互助协会的神秘组织,而大神正是其中的一员。动画在地球的舞台上展开,地球被神秘的外星人德拉克特和几乎所有的人类摧毁了。过去,Ikesia的居民过着普通的生活,对被抹去的毁灭之日的记忆一无所知。Ikesia是人类躲避外星人的避难所。