康一很快就和小咕成了好朋友，他们一起洗澡，一起吃饭，一起睡觉。而其它家庭成员也接受了小咕，小河童成了上原一家的秘密。 一天，小咕提出想回家和伙伴们在一起。康一为了让小咕了解外面的世界，悄悄把它带了出去。小咕发现环境已经面目全非，大吃了一惊，这个不适合就河童生存的地方根本就找不到伙伴。看到小咕难过，康一也不好受。他和小咕一起外出旅行，来到了还保存着河童传说的远野县。两人在美丽的大自然中找到了适合河童生活的地方，小咕愉快地在清澈的河里游了起来，康一也为它高兴。可是，在这里也怎么都找不到其它河童。康一听到村民们说“抓住一只河童能得一千万呢！”，赶忙带着小咕离开了那里。 回到家，康一讶异地撞见了一个小报记者。原来那人听说上原家养着一只河童，一定要拍照。小咕的秘密终于被大家知道了。康一的爸爸被公司勒令一定要让河童上电视。为了上原一家，小咕答应参加电视节目。然而在到场嘉宾里，它看到了一个长得很像杀父凶手的人。就在小咕被恐惧包围的时候，电视节目现场发生了意外。它拼命逃到了外面，然而无论跑到哪里都会看到黑压压的人群。 为了摆脱让它害怕的人类，小咕爬上了东京塔。夏季的烈日照得它精疲力竭。小咕俯瞰着城市，独自低语道：“哪里都找不到一个安静的地方，这里是人类的窝。我已经不行了。我要去爸爸那里……”
理事长的义女——普通部学生的黑主优姬，以及青梅竹马的锥生零担负起学院守护者的职责——处理人类学生与吸血鬼接触时所出现的麻烦。而在零的内心深处，因为4年前父母被杀害而痛恨着所有吸血鬼。 十年前的一个雪夜优姬迷路遭遇恶鬼，幸得贵族吸血鬼玖兰枢所救。十年后，两人在黑主学院再次相遇。对于救过自己性命的枢，优姬心中存着感激与仰慕，枢虽对优姬有好感，但却因种族间的鸿沟刻意远离。而零虽对优姬也有感觉，但坚硬的内心却阻止了他的感情。等待着他们的命运到底是什么......
主人公是马拓，他也是一名无所事事的高中生。他的父亲是一名历史学家，但他在研究期间失踪了，留下他和继母相互依赖。暑假期间，主人公收到了父亲寄来的一个包裹，里面有一个指南针和三颗水晶珠，还有一封写着“时间是可逆的，历史是不可逆转的”的信和一些关于平行世界概念的信。他指示主人公晚上去当地著名的地标性建筑剑点与某人会面。Tuoye按计划在晚上到达剑点，发现他的继母Ayumi和他父亲的研究伙伴Takasami都在场。原本友好的龙藏寺突然转过身来，要求一匹马交出收到的包裹，并拔出枪威胁他。就在关键时刻，一道闪电落下，击中了神社的御神石，导致陀罗昏倒。当拓也醒来的时候，周围没有人。回家睡了一会儿之后，他意识到不对劲。我的继母和龙藏寺都不记得昨晚发生了什么。此刻，他意识到父亲送给他的遗物是一种神奇的道具，可以让人们自由地穿越平行世界。因此，他进行了一系列调查，以找到他父亲的真实下落。
