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全人类被神奇的现象一瞬间石化后过了几千年—— 拥有超人般头脑、天生的科学少年·千空苏醒了。 在文明遭到毁灭的石之世界（STONE WORLD）里，千空决定要用科学的力量复原整个世界。

志恩因为和父亲记性不好而拒绝了一个男人的存在，在母亲的建议下，他接受了一名大学生的指导。知恩冷漠的态度让这位大学生惊慌失措，两人之间产生了微妙的气氛（对父亲有很多不好记忆的知恩在母亲的建议下接受了私人辅导。