远在数千年前，冥界意图将魔爪伸向人间，由此和灵界之主阎王发生一场惨烈的战争，冥界之众最终战败，被封禁在宇宙的尽头。如今掌管冥界的夜魔带着徒众卷土重来，人界面临莫大的危机。 在这生死存亡的关头，幽助、桑原、藏马、飞影等人必须找到代表地、风、火、水、精灵的灵气门，以将能量输送给灵界，而夜魔却将能令盗向冥界。一场正邪之战就此拉开序幕……
C.E.70年2月，地球联合军与ZAFT之间的武装冲突由于“染血的情人节”悲剧而全面升级为地球圈规模的战争。C.E.71年6月，在“非我即敌”的观念驱使下，地球联合军悍然发动了对中立国家奥布联合酋长国的侵略。
本作では“結婚適齢期”を迎えたアラサー主人公・柏崎ゆうが、今カレと元カレの間で揺らぐさまが描かれる。
