泽村饰演的精明强干的外科医生相良与高岛政伸饰演的性格很难对付的院长森山一边对立一边努力的最前医疗组合又回来了。2021年新春特别篇描绘迎来医院创立100週年的前一年，堂上综合医院再次掀起的骚动。
《超级机器人大战·原创世纪》的背景是新西历，人类正式开始进出宇宙2世纪，但因为2次大型陨石的坠下，人们的生活还是维持在21世纪初。到了新西历179年，第3颗陨石“流星3(メテオ3)”坠落于南太平洋的マーケサズ群岛海面。
巴奇梦是一个简单直率的年轻人。他的生活似乎从很小的时候就被定型了：每天早上，他都会被白鸟姐妹中青梅竹马的阿基拉用各种各样的飞脚叫醒，然后吃掉妹妹钦奈做的所有早餐。然后，在和儿时的玩伴打了招呼后，他匆匆忙忙地去了学校。
