时间来到最终决战的两年后，在本应已迎来和平的地球上，怪兽们再度倾巢而出。 与此同时，世界各地相继发生了各种入侵超古代遗迹的事件。而GUTS-SELECT（精英胜利队）也迎来了新的队长——时冈（中村优一 饰），众人开启了调查。
在他去世之前，他给下属留下了一份遗嘱，隐瞒了他去世的消息三年。此前，他的弟弟武田信廉（山崎聪饰）发现了一个替身（中川泰也饰），他是个小偷。他的脸与申铉相似，也就是日本人所说的“影子战士”，并承担了重要任务。就这样，在武田信长的支持和协助下，影子武士从一个小偷变成了被武田家族的正义行为所感动，全心全意地履行自己的职责。他让武田家族和敌人相信他就是信长本人。然而，随着三年的临近，一件意想不到的事情发生了，影子战士被曝光，他被赶走了，武田家族的命运即将结束
